Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmx1aQ9JKU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmx1aQ9JKU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms