Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpa33Q9JKA5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpa33Q9JKA5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpa33Q9JKA5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms