Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx20Q9JJY4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx20Q9JJY4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx20Q9JJY4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms