Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bgrlQ9JJU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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