Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc12a4Q9JIS8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc12a4Q9JIS8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms