Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc22Q9JIG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms