Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx12Q9ER00 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms