Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dgcr8Q9EQM6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dgcr8Q9EQM6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms