Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr1Q9EPQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms