Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xab2Q9DCD2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms