Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx6Q9DBY5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx6Q9DBY5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms