Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrpraQ9DBG7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SrpraQ9DBG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrpraQ9DBG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms