Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rsph3bQ9DA80 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms