Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms