Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34b2Q9D9N2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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