Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Actrt2Q9D9L5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actrt2Q9D9L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms