Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2c55Q9D816 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp2c55Q9D816 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms