Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt34Q9D646 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt34Q9D646 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt34Q9D646 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms