Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D5Q8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D5Q8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D5Q8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms