Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4f1Q9D5Q6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms