Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930513O06RikQ9D549 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms