Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227bQ9D518 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227bQ9D518 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Fam227bQ9D518 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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