Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf1dQ9D4V4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf1dQ9D4V4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf1dQ9D4V4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms