Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930548H24RikQ9D496 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930548H24RikQ9D496 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930548H24RikQ9D496 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms