Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1F3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1F3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1F3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D1F3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms