Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lsm12Q9D0R8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms