Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChtopQ9CY57 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChtopQ9CY57 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms