Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhobtb3Q9CTN4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms