Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gadd45gip1Q9CR59 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gadd45gip1Q9CR59 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gadd45gip1Q9CR59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms