Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc43Q9CR29 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc43Q9CR29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms