Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpb2Q9CQI7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpb2Q9CQI7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpb2Q9CQI7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 815.5 ms