Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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