Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe41Q99PV5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 466.8 ms