Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf8Q99PV0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms