Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80bQ99PT3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80bQ99PT3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms