Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim3Q99PE5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim3Q99PE5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms