Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtpbp4Q99ME9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp4Q99ME9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms