Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clp1Q99LI9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clp1Q99LI9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms