Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gps1Q99LD4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gps1Q99LD4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms