Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Alpk3Q924C5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Alpk3Q924C5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Alpk3Q924C5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Alpk3Q924C5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Alpk3Q924C5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Alpk3Q924C5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms