Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sirt1Q923E4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sirt1Q923E4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Sirt1Q923E4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sirt1Q923E4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sirt1Q923E4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sirt1Q923E4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms