Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps16Q920Q4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps16Q920Q4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps16Q920Q4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms