Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha12Q91Y18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha12Q91Y18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms