Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdha5Q91Y15 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdha5Q91Y15 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms