Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usb1Q91W78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usb1Q91W78 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms