Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot6lQ8VEG6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot6lQ8VEG6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms