Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg8Q8VE18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg8Q8VE18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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