Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3il1Q8VDV3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3il1Q8VDV3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3il1Q8VDV3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms