Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ApobrQ8VBT6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ApobrQ8VBT6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ApobrQ8VBT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms