Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdc16Q8R349 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdc16Q8R349 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms